太和十九年(495年)北魏孝文帝迁都洛阳。
太和二十年(496年)孝文帝为安置北天竺僧高僧跋陀赦建少林寺,公给衣供。跋陀于寺西台建舍利塔,塔后建译经堂。
熙平二年(517年)洛阳永宁寺建成,十七年后毁于火。其间南天竺僧菩提达摩曾见此寺,后入少林寺后五乳峰山洞坐禅。
正光初(520年)跋陀弟子僧稠任少林寺主。
东魏
天平初(534-536年)菩提达摩行化于洛河地区,圆寂后立塔于熊耳山空相寺。
北齐
乾明元年(560年)僧稠圆寂,有《止观法》行世。
北周
承光元年(577年)周武帝下诏毁佛法,少林寺被废。
大象二年(580年)周静帝下诏重兴佛道二教。少林寺复立,更名陟岵寺。
隋
开皇元年(580年)恢复少林寺名。
开皇中(581-600年)隋文帝诏赐少林寺柏谷坞地一百顷。
大业十四年(618年)天下大乱。少林寺被山贼所劫,僧徒拒之。塔院被焚,灵塔尚存。
唐
武德四年(621年)四月廿七日,少林寺上座善护等十三僧,联合伪轘州司马赵孝宰等翻轘州城,执王世充侄王仁则归唐有功。三日后,秦王李世民派员至寺颁赏。
武德五年(622年)少林寺因居伪郑之地,被废省。
武德七年(624年)寺僧不服减省上诉。七月,敕少林寺依旧置立。
武德八年(625年)二月,重赐少林寺柏谷坞地四十顷,水碾一具。
咸亨中(670-674年)高宗巡幸少林寺,御题《金字般若碑》,留幡像及施物。
弘道元年(683年)禅宗大师法如入少林寺。九月廿五日,武则天遣武三思送金、绢等物至少林寺,立《大唐天后御制愿文》,为亡母杨氏造功德。
嗣圣元年(684年)高宗薨,武则天至少林寺为高宗造功德。
永昌元年(689年)法如圆寂,立塔寺东。
开元十一年(723年)十一月,玄宗御书碑额七字及“太宗教书”,遣一行送赐少林寺。
开元十六年(728年)七月十五日,少林寺立裴漼撰《皇唐嵩岳少林寺碑》。
金
金初住持祖端立《妙色那罗延金刚神像碑》。
兴定四年(1220年)住持志隆创设“药局”。
蒙元
称制元年(1242年)曹洞宗宗师万松派遣大弟子福裕住持少林寺。
称制四年(1245年)福裕受忽必烈之命,在少林寺作资戒大会。
定宗三年(1218年)福裕为都僧省总统,收回佛寺237处。
宪宗八年(1258年)忽必烈在哈喇和林主持举行佛、道大辩论。福裕为首僧代表佛教界参与辩论,道士败。
中统元年(1260年)福裕荣膺“光宗正法大禅师”,任大都大万寿寺住持,计十四年。其间分建和林、燕蓟、长安、太原、洛阳五少林。
至元十二年(1275年)福裕圆寂,刊有《雪庭和尚语录》行世。
皇庆元年(1312年)谥福裕为晋国公。
泰定四年(1327年)日本国山阴道但州正法禅寺僧邵元入华,两年后至少林寺,住二十一年,任书记、首座等职。
至正十一年(1361年)三月二十六日,颍州红巾军至少林寺,紧那罗僧以神异阻之。
至正二十一年(1361年)天下动乱,少林寺僧仅存二十多人。

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